Кератин-5

Кератин-5
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	3TNU
Ідентифікатори
Символи	KRT5, CK5, DDD, DDD1, EBS2, K5, KRT5A, keratin 5, EBS2E, EBS2B, EBS2C, EBS1, EBS2A, EBS2F, EBS2D
Зовнішні ІД	OMIM: 148040 MGI: 96702 HomoloGene: 55461 GeneCards: KRT5
Пов'язані генетичні захворювання
	basal-cell carcinoma, epidermolysis bullosa herpetiformis, localized epidermolysis bullosa simplex, generalized epidermolysis bullosa simplex, Dowling-Degos disease
Онтологія гена
Молекулярна функція	• scaffold protein binding; • structural constituent of cytoskeleton; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • structural molecule activity;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • гіалоплазма; • клітинна мембрана; • keratin filament; • екзосома; • Проміжні філаменти; • мембрана; • мітохондрія; • клітинне ядро;
Біологічний процес	• hemidesmosome assembly; • epidermis development; • cytoskeleton organization; • keratinization; • cornification;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	3852
	110308
	ENSG00000186081
	ENSMUSG00000061527
	P13647
	Q922U2
	NM_000424
	NM_027011
	NP_000415
	NP_081287
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

Кератин-5 (англ. Keratin 5) – білок, який кодується геном KRT5, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 590 амінокислот, а молекулярна маса — 62 378^[5].

Належить до великої родини кератинів — структурних білків цитоскелету.

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSRQSSVSFR	SGGSRSFSTA	SAITPSVSRT	SFTSVSRSGG	GGGGGFGRVS
LAGACGVGGY	GSRSLYNLGG	SKRISISTSG	GSFRNRFGAG	AGGGYGFGGG
AGSGFGFGGG	AGGGFGLGGG	AGFGGGFGGP	GFPVCPPGGI	QEVTVNQSLL
TPLNLQIDPS	IQRVRTEERE	QIKTLNNKFA	SFIDKVRFLE	QQNKVLDTKW
TLLQEQGTKT	VRQNLEPLFE	QYINNLRRQL	DSIVGERGRL	DSELRNMQDL
VEDFKNKYED	EINKRTTAEN	EFVMLKKDVD	AAYMNKVELE	AKVDALMDEI
NFMKMFFDAE	LSQMQTHVSD	TSVVLSMDNN	RNLDLDSIIA	EVKAQYEEIA
NRSRTEAESW	YQTKYEELQQ	TAGRHGDDLR	NTKHEISEMN	RMIQRLRAEI
DNVKKQCANL	QNAIADAEQR	GELALKDARN	KLAELEEALQ	KAKQDMARLL
REYQELMNTK	LALDVEIATY	RKLLEGEECR	LSGEGVGPVN	ISVVTSSVSS
GYGSGSGYGG	GLGGGLGGGL	GGGLAGGSSG	SYYSSSSGGV	GLGGGLSVGG
SGFSASSGRG	LGVGFGSGGG	SSSSVKFVST	TSSSRKSFKS

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Література

Eckert R.L., Rorke E.A. (1988). The sequence of the human epidermal 58-kD (#5) type II keratin reveals an absence of 5' upstream sequence conservation between coexpressed epidermal keratins. DNA. 7: 337—345. PMID 2456903 DOI:10.1089/dna.1.1988.7.337
Lersch R., Stellmach V., Stocks X., Giudice G., Fuchs E. (1989). Isolation, sequence, and expression of a human keratin K5 gene: transcriptional regulation of keratins and insights into pairwise control. Mol. Cell. Biol. 9: 3685—3697. PMID 2476664 DOI:10.1128/MCB.9.9.3685
Whittock N.V., Eady R.A.J., McGrath J.A. (2000). Genomic organization and amplification of the human epidermal type II keratin genes K1 and K5. Biochem. Biophys. Res. Commun. 274: 149—152. PMID 10903910 DOI:10.1006/bbrc.2000.3110
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Lersch R., Fuchs E. (1988). Sequence and expression of a type II keratin, K5, in human epidermal cells. Mol. Cell. Biol. 8: 486—493. PMID 2447486 DOI:10.1128/MCB.8.1.486
Xu Z., Dong H., Sun X., Zhu X., Yang Y. (2004). A new keratin 5 mutation (K199T) in a family with Weber-Cockayne epidermolysis bullosa simplex. Clin. Exp. Dermatol. 29: 74—76. PMID 14723728 DOI:10.1111/j.1365-2230.2004.01434.x