CDKN2A

CDKN2A
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2A5E, 1A5E, 1BI7, 1DC2,%%s1A5E, 1BI7, 1DC2, 2A5E
Ідентифікатори
Символи	CDKN2A, CDK4I, CDKN2, CMM2, INK4, INK4A, MLM, MTS-1, MTS1, P14, P14ARF, P16, P16-INK4A, P16INK4, P16INK4A, P19, P19ARF, TP16, cyclin-dependent kinase inhibitor 2A, cyclin dependent kinase inhibitor 2A, Genes, p16, ARF.
Зовнішні ІД	OMIM: 600160 MGI: 104738 HomoloGene: 55430 GeneCards: CDKN2A
Пов'язані генетичні захворювання
	melanoma-pancreatic cancer syndrome, mucosal melanoma, меланома, familial atypical multiple mole melanoma syndrome
Онтологія гена
Молекулярна функція	• NF-kappaB binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • cyclin-dependent protein serine/threonine kinase inhibitor activity; • protein kinase binding; • RNA binding; • DNA binding; • p53 binding; • transcription factor binding; • MDM2/MDM4 family protein binding; • ubiquitin-protein transferase inhibitor activity; • SUMO transferase activity; • disordered domain specific binding; • GO:0090645, GO:0061637 ubiquitin ligase inhibitor activity;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • гіалоплазма; • senescence-associated heterochromatin focus; • клітинне ядро; • ядерні тільця; • нуклеоплазма; • ядерце; • мітохондрія; • GO:0009327 protein-containing complex;
Біологічний процес	• positive regulation of smooth muscle cell apoptotic process; • negative regulation of cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity; • replicative senescence; • G1 phase; • negative regulation of cell-matrix adhesion; • клітинне старіння; • negative regulation of cell growth; • positive regulation of cellular senescence; • positive regulation of macrophage apoptotic process; • клітинний цикл; • Ras protein signal transduction; • negative regulation of phosphorylation; • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated; • negative regulation of NF-kappaB transcription factor activity; • negative regulation of cell population proliferation; • G1/S transition of mitotic cell cycle; • GO:1990376 negative regulation of G1/S transition of mitotic cell cycle; • GO:0097285 апоптоз; • regulation of G2/M transition of mitotic cell cycle; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • regulation of protein stability; • negative regulation of immature T cell proliferation in thymus; • regulation of protein export from nucleus; • negative regulation of protein kinase activity; • negative regulation of proteolysis involved in cellular protein catabolic process; • protein K63-linked ubiquitination; • positive regulation of signal transduction by p53 class mediator; • somatic stem cell division; • protein stabilization; • protein polyubiquitination; • positive regulation of protein sumoylation; • transcription, DNA-templated; • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated; • autophagy of mitochondrion; • apoptotic mitochondrial changes; • regulation of protein targeting to mitochondrion; • protein destabilization; • negative regulation of ubiquitin-protein transferase activity; • positive regulation of apoptotic process; • rRNA processing; • negative regulation of ubiquitin-dependent protein catabolic process; • mitochondrial depolarization; • positive regulation of DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator; • negative regulation of B cell proliferation; • activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process; • regulation of apoptotic DNA fragmentation; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • positive regulation of protein localization to nucleus; • protein sumoylation; • GO:1901313 positive regulation of gene expression; • GO:0060564, GO:1904190 negative regulation of ubiquitin protein ligase activity; • amyloid fibril formation; • negative regulation of protein neddylation;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	1029
	12578
	ENSG00000147889
	ENSMUSG00000044303
	P42771; Q8N726
	P51480; Q64364
NM_000077; NM_001195132; NM_058195; NM_058196; NM_058197;
	NM_001363763
	NM_001040654; NM_009877
NP_000068; NP_001182061; NP_478102; NP_478104; NP_001350692;
	NP_478102.2
	NP_001035744; NP_034007; NP_034007.1
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

CDKN2A (англ. Cyclin dependent kinase inhibitor 2A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 156 амінокислот, а молекулярна маса — 16 533^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEPAAGSSME	PSADWLATAA	ARGRVEEVRA	LLEAGALPNA	PNSYGRRPIQ
VMMMGSARVA	ELLLLHGAEP	NCADPATLTR	PVHDAAREGF	LDTLVVLHRA
GARLDVRDAW	GRLPVDLAEE	LGHRDVARYL	RAAAGGTRGS	NHARIDAAEG
PSDIPD

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинний цикл, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Serrano M., Hannon G.J., Beach D. (1993). A new regulatory motif in cell-cycle control causing specific inhibition of cyclin D/CDK4. Nature. 366: 704—707. PMID 8259215 DOI:10.1038/366704a0
Robertson K.D., Jones P.A. (1999). Tissue-specific alternative splicing in the human INK4a/ARF cell cycle regulatory locus. Oncogene. 18: 3810—3820. PMID 10445844 DOI:10.1038/sj.onc.1202737
Gump J., Stokoe D., McCormick F. (2003). Phosphorylation of p16INK4A correlates with Cdk4 association. J. Biol. Chem. 278: 6619—6622. PMID 12529334 DOI:10.1074/jbc.C200622200
Russo A.A., Tong L., Lee J.O., Jeffrey P.D., Pavletich N.P. (1998). Structural basis for inhibition of the cyclin-dependent kinase Cdk6 by the tumour suppressor p16INK4a. Nature. 395: 237—243. PMID 9751050 DOI:10.1038/26155
Yuan C., Li J., Selby T.L., Byeon I.-J., Tsai M.-D. (1999). Tumor suppressor INK4: comparisons of conformational properties between p16(INK4A) and p18(INK4C). J. Mol. Biol. 294: 201—211. PMID 10556039 DOI:10.1006/jmbi.1999.3231
Yuan C., Selby T.L., Li J., Byeon I.J., Tsai M.D. (2000). Tumor suppressor INK4: refinement of p16INK4A structure and determination of p15INK4B structure by comparative modeling and NMR data. Protein Sci. 9: 1120—1128. PMID 10892805 DOI:10.1110/ps.9.6.1120