GIF (ген)

GIF (англ. Gastric intrinsic factor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 417 амінокислот, а молекулярна маса — 45 416.

GIF
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2PMV, 3KQ4
Ідентифікатори
Символи	CBLIF, IF, IFMH, INF, TCN3, gastric intrinsic factor, intrinsic factor, Intrinsic factor , IF, cobalamin binding intrinsic factor, GIF
Зовнішні ІД	OMIM: 609342 MGI: 1202394 HomoloGene: 3773 GeneCards: CBLIF
Пов'язані генетичні захворювання
congenital intrinsic factor deficiency
Онтологія гена Молекулярна функція • cobalamin binding Клітинна компонента • extracellular region • Мікроворсинки • ендосома • lysosomal lumen • apical plasma membrane • міжклітинний простір Біологічний процес • cobalt ion transport • ion transport • cobalamin transport • cobalamin metabolic process Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	2694	14603
Ensembl	ENSG00000134812	ENSMUSG00000024682
UniProt	P27352	P52787
RefSeq (мРНК)	NM_005142	NM_008118
RefSeq (білок)	NP_005133	NP_032144
Локус (UCSC)	Хр. 11: 59.83 – 59.85 Mb	Хр. 19: 11.72 – 11.74 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAWFALYLLS		LLWATAGTST		QTQSSCSVPS		AQEPLVNGIQ		VLMENSVTSS
AYPNPSILIA		MNLAGAYNLK		AQKLLTYQLM		SSDNNDLTIG		QLGLTIMALT
SSCRDPGDKV		SILQRQMENW		APSSPNAEAS		AFYGPSLAIL		ALCQKNSEAT
LPIAVRFAKT		LLANSSPFNV		DTGAMATLAL		TCMYNKIPVG		SEEGYRSLFG
QVLKDIVEKI		SMKIKDNGII		GDIYSTGLAM		QALSVTPEPS		KKEWNCKKTT
DMILNEIKQG		KFHNPMSIAQ		ILPSLKGKTY		LDVPQVTCSP		DHEVQPTLPS
NPGPGPTSAS		NITVIYTINN		QLRGVELLFN		ETINVSVKSG		SVLLVVLEEA
QRKNPMFKFE		TTMTSWGLVV		SSINNIAENV		NHKTYWQFLS		GVTPLNEGVA
DYIPFNHEHI		TANFTQY

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт іонів, транспорт, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з кобальтом. Секретований назовні.

Література

• Hewitt J.E., Gordon M.M., Taggart R.T., Mohandas T.K., Alpers D.H. (1991). Human gastric intrinsic factor: characterization of cDNA and genomic clones and localization to human chromosome 11. Genomics. 10: 432—440. PMID 2071148 DOI:10.1016/0888-7543(91)90329-D
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Andersen C.B., Madsen M., Storm T., Moestrup S.K., Andersen G.R. (2010). Structural basis for receptor recognition of vitamin-B(12)-intrinsic factor complexes. Nature. 464: 445—448. PMID 20237569 DOI:10.1038/nature08874

Див. також

• Хромосома 11