MYD88

MYD88
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2JS7, 2Z5V, 3MOP, 4DOM, 4EO7
Ідентифікатори
Символи	MYD88, MYD88D, myeloid differentiation primary response 88, innate immune signal transduction adaptor, MYD88 innate immune signal transduction adaptor, IMD68
Зовнішні ІД	OMIM: 602170 MGI: 108005 HomoloGene: 1849 GeneCards: MYD88
Пов'язані генетичні захворювання
	хронічний лімфолейкоз
Онтологія гена
Молекулярна функція	• death receptor binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • TIR domain binding; • identical protein binding; • protein self-association; • Toll-like receptor binding;
Клітинна компонента	• гіалоплазма; • клітинна мембрана; • endosome membrane; • цитоплазма; • клітинне ядро;
Біологічний процес	• response to interleukin-1; • процес імунної системи; • negative regulation of apoptotic process; • MyD88-dependent toll-like receptor signaling pathway; • toll-like receptor signaling pathway; • cell surface receptor signaling pathway; • cellular response to mechanical stimulus; • regulation of inflammatory response; • positive regulation of interleukin-6 production; • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling; • toll-like receptor 9 signaling pathway; • positive regulation of interleukin-17 production; • inflammatory response; • 3'-UTR-mediated mRNA stabilization; • positive regulation of type I interferon production; • positive regulation of interleukin-23 production; • GO:0072468 сигнальна трансдукція; • GO:0051637 defense response to Gram-positive bacterium; • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity; • GO:0097285 апоптоз; • вроджений імунітет; • type I interferon signaling pathway; • GO:1901313 positive regulation of gene expression; • positive regulation of interleukin-8 production; • defense response to bacterium; • interleukin-1-mediated signaling pathway; • cellular response to oxidised low-density lipoprotein particle stimulus; • positive regulation of cytokine production involved in inflammatory response; • Фагоцитоз; • Toll signaling pathway;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	4615
	17874
	ENSG00000172936
	ENSMUSG00000032508
	Q99836
	P22366
NM_001172566; NM_001172567; NM_001172568; NM_001172569; NM_002468;
	NM_001365876; NM_001365877; NM_001374787; NM_001374788
	NM_010851
NP_001166037; NP_001166038; NP_001166039; NP_001166040; NP_002459;
	NP_001352805; NP_001352806; NP_001361716; NP_001361717
	NP_034981
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

MYD88 (англ. Myeloid differentiation primary response 88) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 296 амінокислот, а молекулярна маса — 33 233^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAAGGPGAGS	AAPVSSTSSL	PLAALNMRVR	RRLSLFLNVR	TQVAADWTAL
AEEMDFEYLE	IRQLETQADP	TGRLLDAWQG	RPGASVGRLL	ELLTKLGRDD
VLLELGPSIE	EDCQKYILKQ	QQEEAEKPLQ	VAAVDSSVPR	TAELAGITTL
DDPLGHMPER	FDAFICYCPS	DIQFVQEMIR	QLEQTNYRLK	LCVSDRDVLP
GTCVWSIASE	LIEKRCRRMV	VVVSDDYLQS	KECDFQTKFA	LSLSPGAHQK
RLIPIKYKAM	KKEFPSILRF	ITVCDYTNPC	TKSWFWTRLA	KALSLP

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як імунітет, вроджений імунітет, запальна відповідь, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Semaan N., Alsaleh G., Gottenberg J.E., Wachsmann D., Sibilia J. (2008). Etk/BMX, a Btk family tyrosine kinase, and Mal contribute to the cross-talk between MyD88 and FAK pathways. J. Immunol. 180: 3485—3491. PMID 18292575 DOI:10.4049/jimmunol.180.5.3485
Wan T., Liu T., Zhang H., Tang S., Min W. (2010). AIP1 functions as Arf6-GAP to negatively regulate TLR4 signaling. J. Biol. Chem. 285: 3750—3757. PMID 19948740 DOI:10.1074/jbc.M109.069385
Hardiman G., Rock F.L., Balasubramanian S., Kastelein R.A., Bazan J.F. (1996). Molecular characterization and modular analysis of human MyD88. Oncogene. 13: 2467—2475. PMID 8957090