Open Babel

Open Babel
Тип	Хемоінформатика, Молекулярне моделювання
Розробники	команда розробників Open Babel
Операційна система	Windows, Mac OS, Linux, Android
Мова програмування	C++
Ліцензія	GNU General Public License
Репозиторій	github.com/openbabel/openbabel
Вебсайт	openbabel.sourceforge.net

Open Babel — це вільна прикладна програма, призначена для перетворення різних форматів файлів хімічних структур. Відповідно до своїх можливостей ця програма більше належить до категорії хемоінформатики, ніж до молекулярного моделювання. Доступна для операційних систем сімейства Windows, Unix, та Mac OS. Поширюється на умовах GNU GPL.

Заявлена мета проекту звучить так: «Open Babel це проект, який розробляється і підтримується спільнотою науковців, як кросплатформна програма та бібліотека для потреб молекулярного моделювання, хімії та багатьох інших суміжних, з можливостями перетворення форматів файлів та даних.»

Основні властивості

хімічна експертна система
взаємні перетворення багатьох хімічних форматів файлів
підструктурний пошук (оснований на технології SMARTS)
fingerprint calculation
обгортки для таких мов програмування Python, Perl, Java, Ruby, C#^[2]

Див. також

Avogadro — програма, основана на коді Open Babel, призначення для малювання та редагування молекул
Ghemical — програма, основана на коді Open Babel, призначена для розрахунків молекулярної механіки
JOELib — версія програми Open Babel/OELib, основана на Java
XDrawChem — програма, основана на коді Open Babel, призначена для малювання структур у режимі 2D
Синій обеліск^[3]

Примітки

↑ http://directory.fsf.org/wiki/OpenBabel
↑ Архівована копія. Архів оригіналу за 17 травня 2008. Процитовано 30 березня 2016.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з текстом «archived copy» як значення параметру title (посилання)
↑ Guha, R.; Howard, M. T.; Hutchison, G. R.; Murray-Rust, P.; Rzepa, H.; Steinbeck, C.; Wegner, J.; Willighagen, E. L. (2006). The Blue Obelisk - Interoperability in Chemical Informatics. Journal of Chemical Information and Modeling. Т. 46, № 3. с. 991—998. doi:10.1021/ci050400b. PMID 16711717.

Посилання

Офіційний сайт
E-BABEL [Архівовано 15 лютого 2011 у Wayback Machine.] — інтерактивна версія програми Open Babel в Хімічній Лабораторії Віртуальних Обрахунків
chemCast Episode 003 — в підкасті інтерв'ю Джефа Хуткісона, керівника групи розробників проекту
Конструктивні недоліки бібліотеки OELib

[[http://directory.fsf.org/wiki/OpenBabel_http://directory.fsf.org/wiki/OpenBabel]<span_class="wef_low_priority_links"></span><div_style="display:none"></div>-1] ttp://directory.fsf.org/wiki/OpenBabel

[2] Архівована копія. Архів оригіналу за 17 травня 2008. Процитовано 30 березня 2016.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з текстом «archived copy» як значення параметру title (посилання)

[3] Guha, R.; Howard, M. T.; Hutchison, G. R.; Murray-Rust, P.; Rzepa, H.; Steinbeck, C.; Wegner, J.; Willighagen, E. L. (2006). The Blue Obelisk - Interoperability in Chemical Informatics. Journal of Chemical Information and Modeling. Т. 46, № 3. с. 991—998. doi:10.1021/ci050400b. PMID 16711717.

[2]

[3]