PDPK1

PDPK1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1H1W, 1OKY, 1OKZ, 1UU3, 1UU7, 1UU8, 1UU9, 1UVR, 1W1D, 1W1G, 1W1H, 1Z5M, 2BIY, 2PE0, 2PE1, 2PE2, 2R7B, 2VKI, 2XCH, 2XCK, 3H9O, 3HRC, 3HRF, 3ION, 3IOP, 3NAX, 3NAY, 3NUN, 3NUS, 3NUU, 3NUY, 3ORX, 3ORZ, 3OTU, 3PWY, 3QC4, 3QCQ, 3QCS, 3QCX, 3QCY, 3QD0, 3QD3, 3QD4, 3RCJ, 3RWP, 3RWQ, 3SC1, 4A06, 4A07, 4AW0, 4AW1, 4CT1, 4CT2, 4RQV, 4RRV, 4XX9, 5ACK, 5HO7, 5HO8, 5HKM, 5HNG
Ідентифікатори
Символи	PDPK1, PDK1, PDPK2, PRO0461, PDPK2P, Phosphoinositide-dependent kinase-1, 3-phosphoinositide dependent protein kinase 1
Зовнішні ІД	OMIM: 605213 MGI: 1338068 HomoloGene: 37643 GeneCards: PDPK1
Реагує на сполуку
	OSU-03012, OSU-03012
Онтологія гена
Молекулярна функція	• transferase activity; • nucleotide binding; • protein kinase activity; • phospholipase binding; • insulin receptor binding; • 3-phosphoinositide-dependent protein kinase activity; • protein serine/threonine kinase activity; • phospholipase activator activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • ATP binding; • protein kinase binding; • kinase activity;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • гіалоплазма; • cell projection; • мембрана; • focal adhesion; • клітинна мембрана; • нуклеоплазма; • міжклітинні контакти; • клітинне ядро; • перикаріон; • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення; • GO:0016023 cytoplasmic vesicle;
Біологічний процес	• GO:0007243 intracellular signal transduction; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • extrinsic apoptotic signaling pathway; • negative regulation of protein kinase activity; • фосфорилювання; • T cell costimulation; • stimulatory C-type lectin receptor signaling pathway; • positive regulation of release of sequestered calcium ion into cytosol; • negative regulation of transforming growth factor beta receptor signaling pathway; • hyperosmotic response; • transcription, DNA-templated; • platelet activation; • cellular response to epidermal growth factor stimulus; • Fc-epsilon receptor signaling pathway; • positive regulation of phospholipase activity; • protein phosphorylation; • negative regulation of cardiac muscle cell apoptotic process; • focal adhesion assembly; • negative regulation of toll-like receptor signaling pathway; • GO:0035404 peptidyl-serine phosphorylation; • regulation of endothelial cell migration; • cellular response to insulin stimulus; • protein autophosphorylation; • regulation of mast cell degranulation; • peptidyl-threonine phosphorylation; • type B pancreatic cell development; • T cell receptor signaling pathway; • cell migration; • actin cytoskeleton organization; • regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling; • calcium-mediated signaling; • GO:1904089 negative regulation of neuron apoptotic process; • cellular response to brain-derived neurotrophic factor stimulus; • epidermal growth factor receptor signaling pathway; • positive regulation of protein localization to plasma membrane; • activation of protein kinase B activity; • positive regulation of blood vessel endothelial cell migration; • positive regulation of angiogenesis; • positive regulation of vascular endothelial cell proliferation; • positive regulation of sprouting angiogenesis; • negative regulation of endothelial cell apoptotic process;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	5170
	18607
	ENSG00000140992
	ENSMUSG00000024122
	O15530
	Q9Z2A0
	NM_001261816; NM_002613; NM_031268
	NM_001080773; NM_001286662; NM_011062
	NP_001248745; NP_002604; NP_112558
	NP_001074242; NP_001273591; NP_035192
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

PDPK1 (англ. 3-phosphoinositide dependent protein kinase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 556 амінокислот, а молекулярна маса — 63 152^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MARTTSQLYD	AVPIQSSVVL	CSCPSPSMVR	TQTESSTPPG	IPGGSRQGPA
MDGTAAEPRP	GAGSLQHAQP	PPQPRKKRPE	DFKFGKILGE	GSFSTVVLAR
ELATSREYAI	KILEKRHIIK	ENKVPYVTRE	RDVMSRLDHP	FFVKLYFTFQ
DDEKLYFGLS	YAKNGELLKY	IRKIGSFDET	CTRFYTAEIV	SALEYLHGKG
IIHRDLKPEN	ILLNEDMHIQ	ITDFGTAKVL	SPESKQARAN	SFVGTAQYVS
PELLTEKSAC	KSSDLWALGC	IIYQLVAGLP	PFRAGNEYLI	FQKIIKLEYD
FPEKFFPKAR	DLVEKLLVLD	ATKRLGCEEM	EGYGPLKAHP	FFESVTWENL
HQQTPPKLTA	YLPAMSEDDE	DCYGNYDNLL	SQFGCMQVSS	SSSSHSLSAS
DTGLPQRSGS	NIEQYIHDLD	SNSFELDLQF	SEDEKRLLLE	KQAGGNPWHQ
FVENNLILKM	GPVDKRKGLF	ARRRQLLLTE	GPHLYYVDPV	NKVLKGEIPW
SQELRPEAKN	FKTFFVHTPN	RTYYLMDPSG	NAHKWCRKIQ	EVWRQRYQSH
PDAAVQ

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, серин/треонінових протеїнкіназ, активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, ядрі, мембрані, клітинних контактах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Anderson K.E., Coadwell W.J., Stephens L.R., Hawkins P.T. (1998). Translocation of PDK-1 to the plasma membrane is important in allowing PDK-1 to activate protein kinase B. Curr. Biol. 8: 684—691. PMID 9637919 doi:10.1016/S0960-9822(98)70274-X
Cheng X., Ma Y., Moore M., Hemmings B.A., Taylor S.S. (1998). Phosphorylation and activation of cAMP-dependent protein kinase by phosphoinositide-dependent protein kinase. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 95: 9849—9854. PMID 9707564 doi:10.1073/pnas.95.17.9849
Casamayor A., Morrice N.A., Alessi D.R. (1999). Phosphorylation of Ser-241 is essential for the activity of 3-phosphoinositide-dependent protein kinase-1: identification of five sites of phosphorylation in vivo. Biochem. J. 342: 287—292. PMID 10455013 doi:10.1042/bj3420287
Paradis S., Ailion M., Toker A., Thomas J.H., Ruvkun G. (1999). A PDK1 homolog is necessary and sufficient to transduce AGE-1 PI3 kinase signals that regulate diapause in Caenorhabditis elegans. Genes Dev. 13: 1438—1452. PMID 10364160 doi:10.1101/gad.13.11.1438
Sato S., Fujita N., Tsuruo T. (2002). Regulation of kinase activity of 3-phosphoinositide-dependent protein kinase-1 by binding to 14-3-3. J. Biol. Chem. 277: 39360—39367. PMID 12177059 doi:10.1074/jbc.M205141200